При открытии файла в кварке выскакивает предупреждение:
"This document requires minor repairs", нажимаю «Repair it» — открывается, но никакого криминала не нахожу. В чем проблема?

Я имел нечто похожее, не знаю точно, подойдет Вам или нет:
Serious problems exist when Quark 6 opens a Quark 5 file. If Quark 6 reports that 'This project requires minor repairs.' and you click Repair It then all the layers that existed in the Quark 5 document will disappear leaving only the default layer. The elements that were previously on those layers are still visible until you click on them and they instantly vanish. Hitting F13 for Picture Usage shows the missing images but the 'print' check box is not ticked. Ticking the 'print' check box for one of the 'missing' images and then clicking 'Show' reveals the image... until you try and select it, whereupon it vanishes again. I have checked the file in Quark 5 and there are no problems with any of the layers or the images.

"This document requires minor repairs" - такое сообщение бывает и при открытии 5-й версии документа в 5-ке и, кажется, 4-й - в 4-ке. Не помню, чтобы впоследствии такой документ создавал какие-либо проблемы в работе или печати.
Кстати, Юрсан, "repair it" - это не требование Кварка "исправьте документ!", как ты, наверное, подумал. Это, наоборот, Кварк предлагает сам всё исправить. Так что, если твой случай не попадает в описанную Борисом ситуацию, когда документ, сохраненный в 5-ке, с ошибкой открывается в 6-ке (жуткий глюк!), то особенно беспокоится не стоит.

Документ создавался в 5 - ке, там же и открывался.  Ошибка возникла после того как рубанули свет. Я понял, что Кварк предлагает сам всё исправить, но после пересохранения, та же ситуация. Меня больше беспокоило, что бы не было проблем в печати. Леша ты меня успокоил. Спасибо.

Тогда может быть стоит принять еще какие-то меры. Нехорошо, что при каждом открытии файла Кварк сообщает, что нужны исправления.
Вообще-то, если отдавать в печать PS или PDF, то вроде не должно быть проблем. А если вёрстку - то стоит перестраховаться. Например, если файл не очень большой, то можно стандартным способом перетащить его страница за страницей в новый документ, в режиме просмотра превьюшек (Thumbnails).
Или я неправильно понял, и теперь Кварк уже не ругается на ошибки?

Кварк продолжает ругаться и на других машинах. Можно было бы и перетащить. Но это журнал 70 стр. Сегодня в 10 вечера отправляется поездом в печать. Так, что диск записан, макет сделан. Остались только надежды на лучший исход.

P.S. А все таки интересно, из за чего такое происходит?

ага... ровно такая ситуация позавчера-вчера была...
док сверстан в 5-ке на маке, открыт в 6-ке на пц, затем пересохранен. все ок.
далее пошла коррекция и после некоторого исправления стилей и сохранения возникла такая хрень... (пересохранения до одного места тоже)
... и слой то всего один был (default), так что вродь ничего не пропало.
а так свет не выключали (да и APC стоит), ничего такого... просто кварк свою собственную верстку криво сохраняет.

упрынципе если пересохранить в 5-ю версию, а затем в 6-ю, то мессаг пропадает, хотя у меня его просто через несколько пересохранений отпустило.

зы: индиз фарева. (кстати насколько корректно можно переносить кварковую верстку 5 и выше в индиз? мож тему создать?)

Может это и оффтоп
Была у меня веселая проблема, макет был сделан в 4-м Кварке. Внем же без проблем сохранился, открывался, в общем, нормально работал. А в 5-м не открывался, Кварк тупо выключался без вопросов.... До сих пор не знаю, и чего это он..... При том тоже самое наблюдалось на разных машинах