var myDocument = app.activeDocument;
var myStory = selection[0].parentStory;

// присваиваем стиль абзаца по имени
myStory.appliedParagraphStyle = myDocument.paragraphStyles.item('Body_txt');

// или по номеру в коллекции
myStory.appliedParagraphStyle = myDocument.paragraphStyles.item(2);

.....................................
\\ задаём значение переменных myCLASSIFIEDindex, myCLASS_RUBRICindex
\\ как индексы массива paragraphStyles
.....................................
with (app.activeDocument)
{
.............................................
myStory = selection[0].parentStory;
with (myStory)
{
// здесь мне и требуется применить стиль с индексом myCLASSIFIEDindex
// ко всему тексту, а делее по определённому условию выделить в тексте
// подзаголовки (стиль с индексом myCLASS_RUBRICindex)

for (i=0; i<paragraphs.length; i++)
{
............................................
switch (..............)
{case ХХХХХХХ: paragraphs[i].applyStyle (paragraphStyles[myCLASS_RUBRICindex], true); break;
default:
}

myStory.clearOverrides();